A két levéltár, illetve felettes hatóságaik, a Magyarok Nagyasszonya Ferences Rendtartomány és a Pécsi Egyházmegye között 2019 őszén létrejött együttműködési megállapodás keretében a Pécsi Egyházmegyei Levéltár számos olyan anyaggal gyarapította a Magyar Ferences Levéltár állományát, amely anyagok egykoron és eredendően a Pécsi Egyházmegye területén működő ferences plébániák és rendházak (Dunaföldvár, Máriagyűd, Mohács, Pécs, Siklós, Simontornya, Szigetvár) anyagai voltak. Cserébe a Magyar Ferences Levéltár számos anyagot bocsátott digitális formátumban a Pécsi Egyházmegyei Levéltár rendelkezésére, amelyek 2020. március 18-tól kutathatóvá váltak a pécsi E-Archivumban.
- A Pécsi Egyházmegyei Levéltár E-Archivumában a ferences anyagok az egyes településeknél (PEL.III....) a "diversa" mappákban érhetők el.
- A Magyar Ferences Levéltár állománya szerinti jegyzék
